Historical trekking merupakan kegiatan yang diselenggarakan oleh museum sandi. Kegiatan ini menggabungkan antara aktivitas berjalan menyusuri rute napak tilas persandian indonesia dengan edukasi mengenai sejarah persandian di indonesia khususnya pengetahuan sejarah di masa agresi militer Belanda ke 2 dimana pasukan persandian menyusuri perbukitan di lereng gunung Menoreh dan menemukan sebuah rumah milik warga lalu dijadikan kantor darurat persandian Indonesia. Kegiatan ini diikuti oleh 15 peserta dari berbagai usia. Menjadikannya sebagai tantangan tersendiri dalam melaksanakannya.